ヒューストンには2つの主要な空港があり、世界の150以上の都市を結んでいます。第一位の空港は、全米第9位の交通量をもつ、ブッシュ・インターコンチネンタル空港Bush Intercontinental Airportで、アメリカン航空、ブリティッシュ・エアウェイズ、エールフランス、USエアウェイズなどの主要な航空路線のハブ空港となっています。空港から市内へは、空港内のカウンターでレンタカーを借りるか、もし金銭に余裕があればタクシー、節約したい場合はエクスプレスシャトルやバスなどを利用できます。ヒューストン第二の空港は、ウィリアム・B・ホビー空港William B. Hobby Airportで、国内線の一部が乗り入れています。
‘スプローリング’なヒューストン市内をあちこち見て回りたいのであれば、車は必須です。市内は、州間道路Interstatesが網の目状に広がり、複雑に入り組んでいます。または市内じゅうを運行するバスや、タクシー、ダウンタウンでは無料のメトロ･トロリーなども利用できます。または自転車を利用する‘バイクウェイ・プログラム’も楽しい移動手段です。350マイルもの長いバイク用の道や、道路上の専用レーンが整備されています。